提取方法对于产品活性物质和营养成分含量的影响极大 ， 即使营养成分含量相同 ， 但活性物质的含量可能有很大差异 。 海藻活性成分能最大保持其原有的状态 ， 则其使用效果最佳 ， 目前生产海藻有机肥最好的方法是冷细胞破裂技术 ， 此技术可以最大限度的保持海藻活性物质的活性 ， 其次为生物降解法 ， 可以很好的保存活性物质活性 ， 而化学水解法则较差 。

1、目前国内外绝大部分厂家主要采用化学水解法生产海藻肥 ， 化学水解法最大的缺点在于强碱高温破坏了海藻内源物质的活性 ， 该类产品较多 ， 比如国内小厂家生产的廉价海藻肥料 。

2、生物发酵法的原理是利用微生物在以海藻等为养分的代谢过程中产生的多种酶 ， 将构成海藻的大分子物质降解成小分子、水溶性的物质 ， 因为发酵过程没有化学法的强碱和高温 ， 可以很好的保存海藻中有效成分的活性 ， 一些进口自爱尔兰、挪威等过的海藻肥采用此法生产 。

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