医学微生物专栏 | 近期最值得看的研究成果盘点（20210528）( 七 )

摘要：寄生于哺乳动物皮肤和体腔的微生物在宿主的各种生理功能中起着重要作用。许多研究已经揭示了微生物群和多种疾病之间的密切联系。然而，联系并不意味着因果关系。为了阐明微生物介导的疾病的机制，研究正从关联分析转向因果研究。本文首先介绍了因果推理的计算方法的原理，然后讨论了这些方法在微生物医学中的应用。此外，本文通过干预主义框架来检验理论推断的因果关系的可靠性。最后，本文展示了微生物靶向治疗的潜在因果关系，特别是个性化饮食干预。本文得出结论，全面了解饮食、微生物群、宿主目标和疾病之间的因果关系对未来的微生物群医学至关重要。

原名：Causal Inference in Microbiome Medicine: Principles and Applications
译名：微生物组医学中的因果推理：原理与应用
期刊：Trends in Microbiology
IF：13.546
发表时间：2021.04.21
通讯作者：张红雨
通讯作者单位：华中农业大学信息学院，农业生物信息学湖北省重点实验室
DOI号：10.1016/j.tim.2021.03.015
原文链接：
Gut Microbes科研| Gut Microbes：神经性厌食症患者的肠道菌群和代谢物
本文由大头虾编译
捷克科学院微生物研究所细胞和分子免疫学实验室的Petra Prochazkovav等人于2021年3月28日在Gut Microbes发表题为《The intestinal microbiota and metabolites in patients with anorexia nervosa》的文章。为了阐明肠道微生物群在AN病理生理学中的贡献，该文章主要采用质谱（MS）和核磁共振（NMR）分析了AN患者营养恢复前后粪便标本的SCFA和神经递质水平，并评估了生化、人体测量和心理测量的特征，揭示了严重AN患者的肠道微生物群及其代谢物的变化，为阐明脑-肠道微生物群相互作用提供珍贵资料。

摘要：脑-肠道微生物群相互作用与各种神经和精神疾病密切相关。虽然神经性厌食症（anorexia nervosa ， AN）的病理生理学还不完全清楚，但它可能与微生物群失调有关。本研究的目的是阐明肠道微生物群在AN病理生理学中的贡献。在本研究中，我们分析了营养恢复前后粪便标本中AN患者肠道微生物组的组成和多样性，并与健康对照组进行了比较。此外，通过质谱（MS）和核磁共振（NMR）分别分析了粪便样本中各类神经递质和短链脂肪酸（short-chain fatty acids ， SCFA）的水平，并对生化、人体测量和心理测量的特征进行了评估。细菌α-多样性参数分析显示，在AN患者营养恢复之前， Chao 1指数升高，这反映了个体间的差异。随后，在AN患者中能观察到核心微生物群减少的迹象。在AN患者中，大部分的OTUs（操作分类单位）在分类上属于Alistipes、梭菌